(一)从补充冷却水中除去成垢的钙、镁离子
在补充水进入循环水系统之前进行软化处理，除去Ca2、Mg2 ,也就形不成水垢。目前常用的软化方法有三种：一是通过采用反渗透法(生成纯水)；二是离子交换法(生产去离子水)，该法适用于补充水量小循环水系统间或采用；三、是石灰软化法，即投加石灰，使Ca(HCO3)2反应生成CaCO3沉淀提前析出。该方法成本低，适用于原水(尤其是暂时硬度大的结垢型原水)钙含量高，补充水量较大的循环冷却水系统。
(二)加酸或通入CO2气体，降低pH值，稳定重碳酸盐
在循环水中加酸(通常为硫酸)或通入CO2气体，降低pH值，使下列平衡左移，重碳酸盐处于稳定状态。Ca(HCO3)2=CaCO3 H2O CO2
加酸法目前仍有使用，关键是控制好加酸量，否则酸量过多会加速设备腐蚀。通CO2气体同样应注意控制好pH值，否则循环水通过冷却塔时，由于CO2的溢出，CaCO3在塔内结晶，堵塞填料，形成钙垢转移现象。该方法在某些化肥厂、化工厂及电厂等有CO2气体源的企业仍有推广使用的价值。
(三)投加阻垢剂
在循环水中投加阻垢剂，破坏CaCO3的结晶增长过程，以达到控制水垢形成的目的。目前常用的阻垢剂有聚磷酸盐、有机磷酸酯、聚丙烯酸盐、有机多元磷酸等。这也是目前应用最广的控制水垢的方法。
