在不断发展新农村的形势下，农田水利的管理工作面临越来越多的问题，如水利设备老化、水质环境污染、执法过程遇到障碍等问题，然而这些问题的根本原因是由于农田水利的投入资金严重匮乏、工作环节没有重视可持续发展、制度的建立不健全、保护水利设施意识淡薄等。所以，要加大水利资金的投入、建立健全法制、不断改善水质环境、加强执法力度，成分发挥水利工程的给人们带来的利益、推动新农村向可持续方向发展。建设新农村的同时，水利要先行建设。水利工程的管理工作在新农村建设中十分重要，在新农村的建设过程中大有用处。

　一、农田水利改造建设中存在的问题

　　1改造建设中管理运行问题

　　近年来，农田水利的建设过程中常常会出现重视建设而忽视管理的现象，极度缺乏管理，进而导致很多的农田水利设施存在带病运行的现象，尤其是用户较多，而且生产能力很差的水利工程无法从根本上落实，给国家带来了极大的浪费。管理及运行主要存在两方面的问题，一方面农民对于农田水利的建设的积极性较低，农民没有管理运行的意识，并且基层的干部在思维方式和工作方法上缺少经验，与此同时农民进行民主管理的意识欠缺，进而使得管理的效率极低，带来的成果也很不显著；另一方面，由于建设管理的职能划分模糊，农田水利部门负责小型农田水利的建设，而且实际上较大的农田水利设施建设主要受到国土、发改委、水利或是财政部门的管理，根本没有形成统一的界定，进而增大了管理的难度。

　　2水利设施资产界定以及评估问题

　　小型农田水利建设项目的固定资产具备特殊性，其服务的主体是农民和农业，所以对于资产的划分必须具备明确的原则和标准。现阶段，小型的农田水利设施大多数是掌握在集体和国家的手中，因此对于小型农田水利的评估，怎样进行评估、依据什么样的标准来评估，这些因素将直接影响到农田水利的价格。所以对于小型农田水利的建设要依据正确的方法进行评估，只有这样才能有效的避免流失国有资产。另外，还需要成立专门的资产评议小组，主要负责审定资产，进而为小型农田水利的租赁承包或是拍卖来提供依据。

　　3农田水价的制定以及管理的问题

　　小型农田水利的进行改造建设之后，农民农田用水的价格也就不能再按照先前的标准进行收费了，不应该计入税金和利润，只进行费用和成本的核算，还要考虑到经营者的可持续发展，所以需要重新给水价定位，又由于没有统一的标准进行定位这些问题，导致农民参与到农田水利建设中来的积极性不高，另外还有农民反映到水价的定位不合理，就使小型农田水利的改造建设带来的困难。所以，对于各个部门的水价进行明确的管理界定，要排除水费定位中存在不合理的部分，进而给水价的调整预留出足够的空间。