由于我国基层水利工程固有的特点，也就决定了我国基层水利工程在质量上存在着一些不可避免的问题，主要有以下几点：
1、由于投入资金的不足而导致设计上的不足。在我国基层水利工程中，由于资金投人的不足，因此在工程前期准备上就必定有所缺漏，主要表现在设计方面的不够规范，缺少科学论证。虽然我国在技术方面颁布了一些规定，但是一些地方在基层水利工程施工过程中还是我行我素，视规范如无物。
2、技术落后。在我国的基层水利建设过程中，由于资金的不足而导致设备配置上和技术人员的不足，使得整个工程的技术水平远远落后于大型水利工程。另一方面，由于工期太短，所以工程进度较.陕，工作较繁忙，工作人员参与培训和学习的机会较少，工作人员在提高技术上没有发展的空间，这也是基层水利工程整体技术水平无法提高的瓶颈所在。
3、思想认识水平不够。基层水利工程多是地方建设，上至工程负责人，下至工程施工人员的思想意识水平都不够高，对工程质量问题认识薄弱，甚至没有认识，这直接导致了工程质量出现问题；另一方面，基层水利工程部门较小，并没有完整的质量监管体系，导致无法对工程质量实行实施监管。
