“百年大计，质量第一”，优质合格的水利工程的建设完成，为农业生产和人民日常生活奠定了一个良好的基础；但是，要使其长期充分地发挥其经济效益，作为以后水利工程建设起到一个参照示范的作用，加强对已有工程的使用管理和维护就显得尤为重要。
一是安全管理。安全管理的首要是加强《水法》的宣传，在防止水利工程受到洪水等自然灾害的侵袭的同时，也要防止少部分惟利是图的人为破坏；其次是工程建设工程没有主次，每个环节都很重要，特别是工程配套设施的建设质量一定要保证。
二是内业资料管理。关于工程管理的标准、规定、法律等资料必须齐全；设计图纸及文件、施工记录、检测结果、竣工验收报告等应立项建档；工程建设中出现的问题及解决的结果以及工程管理的各项检查记录资料也应当妥善保存。
三是工程设施管理。对小型水利工程设施，登记造册，绘制工程分布图分类进行排列，对重点工程实施挂牌，设专人重点管理，落实目标责任制，确保已有工程项目特别是重大型项目的设施管理安全。
四是经费管理。制定合理的工程维修养护费标准，根据受益面积和各地的具体情况，向受益者和收益单位征收一定的费用，用于工程维护；利用水利发展基金等形式对工程进行维修和养护；推行义务工制，接受受益人或者单位的义务工。
五是技术推广和人才培养。水利工程建设是效益长期的工程，因此建设规划必须具有发展的眼光。地方水利部门可以采取派出去，请进来，实行短期培训等方法，抓好管理人员的业务培训，提高管理人员的业务水平；同时要抓好工程建设中的新技术的推广应用工作，让农田水利建设与日益反展的农业生产和人民生活相适应，使已有的、在建的和规划中的水利项目都能充分发挥其自身的效益，服务于民。
