1、要建立专项工程账目管理机制

建立专项工程账目，确保专款专用是对整个水利工程的建设，意义重大，有专门的资金管理部门，能使资金的使用率达到最大化，如小型农田水利建设资金要专账、专户与专人管理，要按工程进度拨款，并严格按照相关的规定办事，不能越级对资金的使用，而且在使用之后，有详细的记录。资金流转要通过银行转账或电汇，工程完工后要及时办理竣工决算。

2、要建立工程效益审计制度

当前我国农田水利工程很少有专业的工程效益审计制度，这就导致其价值不能达到最大化，甚至影响了原本的价值体现。这就要求工程完工后，要抓好跟踪审计，并组织专业的人员进行文件记载，把工作中难以解决的问题与相关解决措施及工整的清晰的记录，认真进行总结工作经验，只有这样才可制定更好、可行的发展策略。

3、努力深化与完善农村水利改革

对现代农业，以往传统的小面积的农田水利工程，已不在适合。对于现代农田来说，要建造大型且功能多面化的新型水利工程，这样才能更快的发展中国的农业。

（1）推动小型农田水利工程产权制度改革健康深入发展，努力把其作为标准化的工程建设。

（2）要以水利工程为单元，通过对基层水利队伍的改组、改造及改革与完善。

（3）培养农民群众的水利管理专业知识，雇佣农民工作为工作人员，由于水利工程就是给自己家建造的，有利于自已，因此会主动保护好工程。

4、要扩大投资

要使水利建设资金合理分配，做到区域内的平衡与和谐建设，水利建设管理部门要对现有工程进行维修扩建与改造，以确保对农田水利基础设施的建设，适应农村水利发展的要求。并且在增加地方财政投入的同时，地方政府也加强了对农村小型水利工程建设的行政领导，积极调动组织群众参与水利工程建设的积极性，充分发挥政府资金的引导作用，鼓励村民投入到水利工程建设当中去，以节省人力资金，以免出现由于资金短缺使得一些重点工程延误。

5、要加强对农田水利工程建设的监管力度

制定一套完善的工程建设管理制度，同时组建一个完整的质量监督体系，自上而下，齐抓共管。农村小型农田水利工程内容广泛，要实行统一管理，合理规划布局，完善建设程序。建立健全资质认证制度，落实工程招投标制度，规范施工管理，明确工程投资，实行施工准入证制度与工程监理制度，加强竣工验收备案制度和严格奖惩制度，使农村中小型水利工程建设朝着规范有序方面发展。依据各种不同农村水利的特点，对不同功能的水利工程采取相应的管理措施，使水利工程在完善的工程管理条件之下，取得较好的工程效益。