1.工程造价的形成缺乏市场机制。建筑业的招投标制虽然在建立市场价格机制方面做出了一定的贡献，但是由于建筑工程的招投标是在计划价格的基础上实行，很大程度上限制了施工单位的自主报价，所以目前的市场价格机制不能算是完全意义上的市场价格机制。
由于政府尚未能彻底转变职能，存在地方保护和行业保护，另外，由于招标信息不充分等原因，造成建筑市场透明度差、缺乏公平竞争性，这也在很大程度上影响了工程造价形成过程的合理性。
2.建筑业价格体系同建筑业的资源分配优化相脱节。我国建筑市场供给能力总量多年来一直大于社会固定资产投资总额对建设的需求，指导价格水平理应呈下调趋势，但由于建筑产品的价格历史欠账过多，人工费、机械费等远低于消耗，所以形成价格经常上调的局面。这种上调的结果，实际上使价格信号失真，导致刺激建筑业供给能力总量进一步膨胀。
我国目前的工程价格机制是通过定额配价（及发布价格信息、指数调整等），价格长期固化在定额之中。这种“量价合一”形式的定额概预算制度，是对工程实施“半管制”。这种工程价格管理机制不可能达到价值规律自发调节建设市场供求关系的目标。另外，定额水平相对较高（符合一般国有企业的水平），虽然在一定程度上保护了国有大中型施工企业，但由于工程价格存在较大的获利空间，从而使新的供给不断扩大，再加上配套措施不健全，这种办法实际上鼓励投资企业优先选择低价的乡镇企业，加剧了建筑市场的膨胀和无序竞争。
3.造价信息工作落后。在市场经济社会中，能否及时、准确地捕捉到市场价格信息是业主和承包商占有竞争优势和取得盈利的关键。在国外，政府定期发布工程造价信息，以供各类估算师对政府工程的估算作参考。同时，社会咨询公司也发布价格指数、成本指数等造价信息来指导工程项目的估价。
